Начиная с 2010-2011 учебного года, на факультете инноваций и высоких технологий МФТИ открывается набор на направление подготовки «Прикладная математика и информатика». От традиционного для МФТИ направления подготовки «Прикладные математика и физика» новое направление отличается существенно большим количеством курсов по информатике и дискретной математике и существенно меньшим - по физике. Вступительные испытания для абитуриентов, поступающих на направление «Прикладная математика и информатика», проводятся по математике, информатике и русскому языку. В процессе обучения важная роль отводится исследовательской работе в области теоретической информатики и дискретной математики, а также участию студентов в олимпиадах по программированию.

С проектом учебного плана ФИВТ по направлению «Прикладная математика и информатика» можно ознакомиться на сайте факультета.